Až 1/3 průjmových onemocnění je vyvolaná viry. Virový průjem může postihnout kteroukoliv věkovou skupinu, ale zejména zranitelné jsou děti (zejména kojenci a batalota) a starší lidé.
Mezi hlavní původce virových průjmů patří: rotaviry (až 40 % průjmových onemocnění u dětí), noroviry, adenoviry, astroviry, coronaviry.